Étude de quelques alcaloïdes comme agents antiviraux potentiels contre la protéase principale du SARS-CoV-2 in silico

Abstract

Le coronavirus (COVID-19) est une nouvelle maladie infectieuse du syndrome respiratoire aigu sévère, qui devenu la préoccupation sanitaire mondiale en raison de sa nature hautement contagieuse. Elle est apparue initialement en décembre 2019 à Wuhan, en Chine et s'est rapidement propagée dans le monde entier. Le but de ce travail est d’évaluer in silico l'effet d'inhibition de dix alcaloïdes en tant que molécules pures sur la protéase principale (Mpro) du SARS-CoV-2 en utilisant les programmes AutoDock vina et Discovery studio visualiser, les inhibiteurs choisis sont : Canthine-6-one, Infractine A, Infractine B, Scaurine A, Scaurine B,Stephano-sporine, mycearbine A, Mycearbine B, SanguinoneA, Sanguinone B, les paramètres ADMT ont été vérifiés pour confirmer leurs paramètres pharmacocinétique à l'aide du serveur preADMT 2.0, les inhibiteurs les mieux classés ont été choisis en fonction de leur profil ADMT,la valeur d’énergie la plus faible (VEM), et le taux de répétition (TR) le plus élevé. Les résultats obtenus montrent que Mycearubin B est le meilleur inhibiteur parmi les dix autres molécules avec une valeur TR de 60% et VEM de – 8,1 kcal/mol, Tandis que la Scaurin B est le modèle d’inhibiteur le plus faible avec un TR de 60% et un VEM de -6,3 Kcal/mol. L’amarrage moléculaire des dix ligands sur Mpro montre des résultats prometteurs qui pourraient être efficace contre le corona virus, des études in vivo doivent être réalisées pour confirmer son efficacité.